MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187109	C	7	7	1	7	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NT_187109	G	10	10	8	17	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187109	A	6	6	30	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187109	TGG	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187109	TTC	2	6	1389	1394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NT_187109	A	6	6	1429	1434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NT_187109	ACTT	2	8	1452	1459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NT_187109	CAAA	2	8	1483	1490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NT_187109	ATT	2	6	1495	1500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187109	CGA	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187109	AAT	2	6	1575	1580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187109	AAAT	2	8	1757	1764	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NT_187109	ATG	2	6	1795	1800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187109	AAT	2	6	1848	1853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187109	A	8	8	1892	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187109	AC	3	6	1979	1984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NT_187109	CCA	2	6	2012	2017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NT_187109	AAC	3	9	3052	3060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187109	TCA	2	6	3095	3100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NT_187109	GCA	2	6	3131	3136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NT_187109	TATT	2	8	6251	6258	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187109	GA	3	6	7382	7387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187109	GAC	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NT_187109	TTTTCA	2	12	9203	9214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NT_187109	CAGTA	2	10	9219	9228	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NT_187109	TTA	2	6	9273	9278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NT_187109	GT	4	8	9281	9288	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NT_187109	T	7	7	10604	10610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187109	CAT	2	6	12822	12827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NT_187109	TA	3	6	12828	12833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187109	AAT	2	6	12843	12848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187109	AGC	2	6	12901	12906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NT_187109	CAAA	2	8	12909	12916	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NT_187109	AGC	2	6	12928	12933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NT_187109	TGG	2	6	12998	13003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187109	CATGC	2	10	13035	13044	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NT_187109	TGG	2	6	13116	13121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NT_187109	CATGC	2	10	13153	13162	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NT_187109	CAT	2	6	13223	13228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NT_187109	AGT	2	6	13328	13333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187109	CTGCC	2	10	14191	14200	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NT_187109	ACG	2	6	15820	15825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NT_187109	AACA	2	8	15826	15833	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NT_187109	CA	3	6	15887	15892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NT_187109	AGG	2	6	15934	15939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187109	CGG	2	6	15944	15949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NT_187109	TCA	2	6	15960	15965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NT_187109	ACT	2	6	15973	15978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NT_187109	CCG	2	6	15990	15995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NT_187109	AGG	2	6	16055	16060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187109	CGG	2	6	16065	16070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187109	TCA	2	6	16081	16086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NT_187109	CAC	2	6	16089	16094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NT_187109	AGG	2	6	16172	16177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187109	CGG	2	6	16182	16187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NT_187109	TCA	2	6	16198	16203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NT_187109	CAC	2	6	16206	16211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NT_187109	CCA	2	6	16284	16289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NT_187109	A	6	6	16294	16299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NT_187109	T	6	6	16315	16320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187109	TGCGC	2	10	16352	16361	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NT_187109	GAC	2	6	16376	16381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NT_187109	GAC	2	6	16427	16432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NT_187109	GAC	2	6	16478	16483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NT_187109	CAT	2	6	16531	16536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NT_187109	TCA	2	6	19913	19918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187109	TTGC	2	8	19987	19994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NT_187109	TTAA	2	8	20043	20050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187109	TAA	2	6	20056	20061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NT_187109	CA	3	6	20887	20892	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NT_187109	AGAT	2	8	20898	20905	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187109	AT	3	6	21846	21851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187109	A	6	6	25172	25177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NT_187109	TGT	2	6	26222	26227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187109	CCA	2	6	26240	26245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NT_187109	CAAGTG	2	12	26286	26297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NT_187109	GCA	2	6	26312	26317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NT_187109	T	6	6	26348	26353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187109	ATT	2	6	27264	27269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187109	CTGG	2	8	27313	27320	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NT_187109	A	6	6	28363	28368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187109	T	6	6	28385	28390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NT_187109	TCACC	2	10	28409	28418	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NT_187109	ATT	2	6	28462	28467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NT_187109	GCC	2	6	28668	28673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NT_187109	GAA	2	6	31321	31326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187109	T	8	8	31345	31352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187109	GCC	2	6	31365	31370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NT_187109	GCG	2	6	31384	31389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NT_187109	CAG	2	6	32580	32585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NT_187109	AAT	2	6	32638	32643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NT_187109	TTA	2	6	34687	34692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NT_187109	ACG	2	6	35119	35124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187109	TCA	2	6	40013	40018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NT_187109	TA	3	6	40052	40057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NT_187109	TGA	2	6	40063	40068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187109	TCCC	2	8	40097	40104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NT_187109	GAG	3	9	40115	40123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187109	ATCA	2	8	40130	40137	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NT_187109	TAA	2	6	40984	40989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187109	A	7	7	41037	41043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187109	GCGCT	2	10	41091	41100	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NT_187109	AAGCG	2	10	42131	42140	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NT_187109	CTTT	2	8	42742	42749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NT_187109	ATTA	2	8	42751	42758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187109	GTTG	2	8	42761	42768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NT_187109	A	6	6	43740	43745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NT_187109	TGAAA	2	10	43772	43781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NT_187109	TCA	2	6	43795	43800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NT_187109	CGT	2	6	43806	43811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187109	CGATA	2	10	43823	43832	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NT_187109	CCGC	2	8	46047	46054	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NT_187109	ACAGT	2	10	46074	46083	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NT_187109	TGA	2	6	47415	47420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NT_187109	GC	3	6	47442	47447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NT_187109	GGC	2	6	47459	47464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NT_187109	GC	3	6	47469	47474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NT_187109	ACCA	2	8	47487	47494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NT_187109	GCC	2	6	47532	47537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NT_187109	CGCC	2	8	48665	48672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
121	NT_187109	TCA	2	6	50784	50789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187109	GC	3	6	58698	58703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NT_187109	CTTT	2	8	61803	61810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NT_187109	AAT	2	6	61963	61968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187109	CCA	2	6	62044	62049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NT_187109	T	6	6	62426	62431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NT_187109	AGAA	2	8	62490	62497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NT_187109	AAT	2	6	62633	62638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187109	AC	3	6	65313	65318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NT_187109	ACTTT	2	10	65328	65337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NT_187109	AAC	2	6	68734	68739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NT_187109	AAC	2	6	69796	69801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187109	AAC	2	6	69813	69818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NT_187109	GC	3	6	69842	69847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NT_187109	T	6	6	69882	69887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NT_187109	AT	3	6	69898	69903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187109	T	8	8	69907	69914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187109	CTG	2	6	70545	70550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NT_187109	ATC	2	6	70687	70692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NT_187109	CCA	2	6	72008	72013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NT_187109	GC	3	6	72048	72053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NT_187109	GTA	2	6	72072	72077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187109	GCC	2	6	72111	72116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NT_187109	GCG	2	6	72121	72126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NT_187109	AAG	2	6	72206	72211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187109	CTTC	2	8	72229	72236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NT_187109	TCA	2	6	72271	72276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NT_187109	T	6	6	72384	72389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.